怀孕初期深褐色分泌物可能是受精卵着床、过度劳累、宫颈炎等原因导致的。患者可以到医院检查，确定原因，对症治疗。
1、受精卵着床：怀孕初期，受精卵着床会对子宫内膜产生刺激，引发部分脱落，出现少量流血的情况，血液进入分泌物中，经过氧化反应会出现褐色，属于正常的生理现象，一般不需要特殊治疗。
2、过度劳累：如果怀孕后不注意休息，做了大量的家务，或者进行了体力劳动，可能会导致阴道出现少量出血，分泌物出现褐色的情况。可以通过卧床休息、局部热敷、轻柔按摩等方式减轻症状。
3、宫颈炎：在炎症因子的刺激下，子宫内膜可能会出现损伤，引发少量出血，导致分泌物出现褐色，可以遵医嘱使用消糜栓、保妇康栓、康妇消炎栓等药物治疗。
除了以上常见的原因外，还有可能是先兆流产导致的，具体的原因可以到医院检查针对性治疗。
