治疗功能性消化不良的方法主要是生活饮食改善、口服药物治疗、理疗等，这是比较两种抢到的方式，每个人选择的方法会不同。
1、生活饮食改善：如果在生活当中出现了功能性消化不良，首先要在生活饮食上改善，尽量选择以清淡的食物为主或容易消化类的食品为主，可以吃水果和蔬菜，然后适量做运动，能使患者的状况有所恢复。
2、口服药物治疗：功能性消化不良的患者，必要时可以根据医生指导服用药物治疗，特别是出现了胃腹部烧灼感，可以遵医嘱服用奥美拉唑钠肠溶片和多潘立酮片等药物，具有恢复的效果。
3、理疗：功能性消化不良也能选择理疗的方式，主要是在腹部沿着顺时针方向按摩和热敷，对于恢复也是有帮助作用的。
除此以外，也能选择药物和生活饮食同时做调整。
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