胃肠炎最常见的症状是腹泻，其他症状包括：腹痛、恶心、呕吐、发热、食欲减退、体重减轻（可能是脱水的征象）、大量出汗、皮肤湿冷、肌肉痛或关节僵硬、大便失禁等。
剧烈的呕吐和腹泻可以很快导致脱水，其表现有虚弱、极度口渴、少尿或尿色加深、皮肤干燥、口干、眼球下陷，婴儿还可表现为啼哭时少泪。严重的呕吐或腹泻可以引起低钠血症、低钾血症、低血压等。饮用大量含盐少或不含盐的水分来补充液体的病人尤易出现低钠血症。水和电解质紊乱有潜在的风险，特别是对于病重、虚弱、年幼或年老的患者，严重的病例可以出现休克和肾衰竭。
治疗胃肠炎应禁食、纠正水电解质紊乱。通常患者只需卧床休息并饮用足量的水分（如口服补液盐溶液）即可。即使是呕吐的患者也要尽量多饮水。哺乳期的婴儿应继续哺乳。如果呕吐或腹泻持续时间较长或有严重脱水，有必要进行静脉补液。呕吐剧烈时可加用止吐药。如果腹泻持续时间超过24～48小时并且没有迹象表明有更严重的细菌感染，可加用止泻药。通常儿童不建议使用止吐药和止泻药。
由于抗生素可能会引起腹泻或促进耐药菌生长，即使胃肠炎的致病菌已经明确，抗生素通常也不建议使用。但是，某些病原菌（如弯曲杆菌、志贺菌、霍乱弧菌等）感染或患者有旅行者腹泻，可使用抗生素。
对于病毒感染所致的胃肠炎，抗生素并无效果。寄生虫感染所致胃肠炎需使用抗寄生虫药物。
