研究表明，出生时，婴儿的消化系统功能尚未完善，因此可能无法完全消化和吸收所有营养素。更确切地说，有些酶对消化和吸收乳糖和蛋白质是至关重要的，但在婴儿出生时可能尚未完全活化。
一部分婴儿会对牛奶蛋白产生不同程度的不耐受现象，常表现为不同程度的上火、湿疹，严重者可出现腹泻，甚至便血。牛奶蛋白是婴幼儿最早接触的、最常见的过敏原。一般婴儿只是对牛奶蛋白不耐受，但个别宝宝对母乳蛋白也会不耐受。对于不能纯母乳喂养的乳蛋白过敏高风险宝宝，与常规牛奶蛋白配方相比，采用部分水解蛋白配方可预防或推迟婴幼儿早期特应性皮炎和牛奶蛋白过敏的发生
除了饿了、困了、累了等原因，宝宝的肠胃不舒服也是哭闹的常见原因，小宝宝的肠道发育尚未完善，百天之内的宝宝经常会出现胀气，因此民间有“新生儿百日哭”的说法。另外，如果宝宝是混合喂养，每日都会出现无规律阵发性哭闹、吐奶、排气多，排便次数多且大便稀，就应考虑是不是牛奶蛋白不耐受或者乳糖不耐受。可以尝试更换部分水解蛋白同时较低乳糖的配方奶粉。
由于宝宝消化系统尚未发育成熟，消化道中的乳糖酶并未完全活化，降低乳糖水平可能对出现乳糖敏感性相关症状的婴儿有利。与全乳糖的常规配方奶相比，乳糖含量大幅度降低能帮助宝宝减少乳糖不耐受症状,从而更容易被宝宝稚嫩的肠胃吸收，减轻上火、消化不适的症状。
6~12个月宝宝已经添加各种辅食了。有的宝宝进食量过少，食物经过胃肠消化吸收后，剩下的食物残渣少，影响肠道蠕动，所以不会有便意。还有些宝宝偏食，爱吃肉，不爱吃菜、吃水果，纤维素含量少，肠道缺乏刺激，加上排便习惯不佳，宝宝上火、便秘就会找上门。
