近年来的研究证明沙眼病原体为衣原体的一种，界于细菌与病毒之间，简称沙眼衣原体。在卫生条件差的流行区，常有重复感染。
原发感染使结膜组织对沙眼衣原体致敏，再遇沙眼衣原体时，可引起迟发超敏反应。这可能是沙眼急性发作的原因，是重复感染的表现。随着生活水平的提高，沙眼的发病率已大大降低。
沙眼的并发症主要有睑内翻及倒睫、沙眼性角膜溃疡、上睑下垂、沙眼性眼干燥症。
1、睑内翻及倒睫
在沙眼的后期，病变可侵及睑板，因瘢痕组织收缩而变短，加之睑结膜，特别是睑板上沟部位因瘢痕而收缩，遂使睑板向内弯曲如舟状，形成典型的睑内翻倒睫。倒睫亦可单独发生，乃由于毛囊附近受病变侵犯后产生的瘢痕所致。倒睫的长期刺激，可使角膜浅层呈现弥漫性点状浸润，继而上皮剥脱，形成溃疡，称沙眼性角膜炎或沙眼性角膜溃疡。此时病人出现异物感、怕光、流泪、疼痛及视力模糊等症状。
2、沙眼性角膜溃疡
在血管的末端有灰白色点状浸润，一旦破溃，即形成浅层溃疡，这些溃疡可以互相融合，形成小沟状溃疡。这种由沙眼血管所引起的溃疡，与倒睫所引起者，均称为沙眼性角膜溃疡。
3、上睑下垂
由于上睑结膜及睑板组织增生肥厚，使上睑重量增加；同时病变侵及苗勒氏肌和提上睑肌，使提睑功能减弱，因而发生上睑下垂。
4、沙眼性眼干燥症
由于结膜表面瘢痕化，将结膜的付泪腺及杯状细胞完全破坏，泪腺排泄管在上穹窿部的开口也被封闭，粘液和泪液完全消失，结膜及角膜变干燥，严重时结膜角膜呈弥漫性实质性混浊，上皮角化、肥厚，形似皮肤、视力极度降低。
沙眼的临床表现多为急性发病，病人有异物感，畏光，流泪，较多黏液或黏液脓性分泌物。
1、急性沙眼
呈现急性滤泡结膜炎症状，眼睑红肿，结膜高度充血，因乳头增生睑结膜粗糙不平，上下穹隆部结膜满面滤泡，合并有弥漫性角膜上皮炎及耳前淋巴结肿大，数周后可转为慢性期。
2、慢性沙眼
可因反复感染，病程迁延数年至十多年，充血程度减轻，有乳头增生及滤泡形成，滤泡大小不等，可显胶样，病变以上穹隆及睑板上缘结膜显著，同样病变亦见于下睑结膜及下穹隆结膜，严重者甚至可侵及半月皱襞。
沙眼是一种慢性传染性眼病，是由衣原体所引起的通过患者眼分必物污染的手指、手帕、毛巾、脸盆及其他公用物品而传播预防沙眼关键在于做好个人卫生
1、经常洗手，不用脏手擦眼睛，手帕要经常洗晒
2、推广分巾分水，一人一巾
3、加强对服务性行业的卫生管理，做好毛巾用具的消毒工作
4、定期检查，做到早发现、早治疗检查者的双手必须每检查一个人后双手浸入消毒液中，以防交叉感染
5、发现沙眼或疑沙，都要进行治疗，常用药物有10％~30％磺胺醋酰钠液，0.1％利福平，酞丁胺液或0.5％新霉素液等每日滴3~4次，以2~4周为一个疗程，然后再复查，末愈者继续复治至治愈为止
6、治疗后一定要严格讲究个人卫生，以防止再感染
沙眼是由沙眼衣原体感染引起的一种慢性传染性疾病，一般本病需要做下面的检查：
1、病原学检测
（1）涂片检测衣原体包涵体是最常用的筛选方法，可用于高危人群的筛选。
（2）细胞培养法认为是检测沙眼衣原体的金标准，但费时，且要求一定的设备技术条件。
2、分子生物学方法
原位杂交法检测宫颈或直肠活检标本中沙眼衣原体DNA，亦可用PCR法检测，可明显提高检测敏感性，且可用于鉴定其种及血清型，可用于诊断，疗效判断及流行病学调研。
PCR法可用于诊断和治疗后疗效的评价，但须注意在停药后疗效随访时，发现有的用直接免疫荧光法查抗原已为阴性，但PCR法仍为阳性，可能为残留部分病原DNA于体内，不表示有病原体存在。
沙眼患者在采用药物治疗的同时还要注意日常饮食，以起到辅助治疗的作用。
一、沙眼患者宜食用的食物
1.多吃具有明目作用的食物，如枸杞、香蕉、桑椹子等。
2.多吃新鲜的水果和蔬菜。
3.多吃含含维生素a的食物。
二、沙眼患者忌食用的食物
1、不能吃辛辣刺激性食物，如辣椒，生姜，火烤的食物等。
2、忌油腻食物，如肥猪肉、肥牛腩等。
1、药物治疗
沙眼衣原体对四环素族、大环内酯类及氟喹诺类抗菌药物敏感。局部可滴用0、1％利福平或15％磺胺醋酰钠滴眼液，晚上用四环素软膏或红霉素软膏。急性期或严重的沙眼应全身应用抗生素治疗，可口服多西环素或红霉素。
2、手术治疗
用于眼部并发症，如严重的内翻倒睫、性病性淋巴肉芽肿引起的化脓性淋巴结炎、象皮肿等。