怀孕五周肚子隐隐作痛可能是生理性因素、异位妊娠、先兆流产等，需要确定是否有阴道出血症状。
1、生理性因素：怀孕5周属于孕早期，女性子宫在胎盘发育过程当中会慢慢变大，体内激素水平也会上升，会导致子宫韧带受到牵拉，容易出现腹部疼痛和腰痛等症状。
2、异位妊娠：怀孕之后需要及时到医院做B超检查，观察是否有异位妊娠现象，如果胚胎着床在宫腔以外的位置可能会导致腹部隐隐作痛，确诊后要及时遵医嘱终止妊娠。
3、先兆流产：怀孕5周如果有先兆流产肚子也会有隐痛感，子宫有收缩现象，阴道还会有出血症状，可能是胚胎发育不良或者受到外界刺激，如果符合保胎条件可以在医生指导下适当使用黄体酮胶囊、地屈孕酮片、黄体酮注射液等。
怀孕5周肚子隐隐作痛还有可能是胃肠功能紊乱、稽留流产等，要针对性治疗。
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