肛门附近长小颗粒可能是肛周湿疹、过敏、尖锐湿疣等因素导致，需要明确原因对症治疗。
1、肛周湿疹：肛周湿疹可能是局部因素导致的，比如创伤、摩擦，也可能与精神因素、消化系统功能障碍有关，经常在肛周部位出现针尖粟粒大小的丘疹、丘疱疹，严重时会出现小水疱，从而导致肛门附近长小颗粒。可以在医生指导下使用他克莫斯软膏、氧化锌糊剂、盐酸氯雷他定片等药物治疗。
2、过敏：如果本身是过敏的体质，肛门局部清洁不够或内衣裤换取不及时，容易导致肛门出现过敏反应，引起局部出现小颗粒，同时伴有瘙痒症状。可以在医生指导下使用炉甘石洗剂、盐酸氯雷他定片、盐酸苯海拉明片
3、尖锐湿疣：主要是人乳头瘤病毒感染导致的，经常在肛门和外生殖器的皮肤黏膜上出现赘生物，从而会引起以上症状。可以通过激光、冷冻、电凝等方法治疗。
除了以上原因，也可能是反复的肛乳头炎性充血肿大造成，具体原因需要到医院就诊检查，然后进行针对性治疗。
