阴茎上有黑色的东西可能是色素沉着、包皮过长、阴茎湿疹等原因引起，需要根据具体的情况对症治疗。
1、色素沉着随着年龄的增长或过度摩擦可能会引起阴茎不会出现色素沉着，导致出现黑色的东西，阴茎部位处于不明显的位置，一般无需做特殊治疗。
2、包皮过长先天发育不良可能会导致包皮过长，阴茎内的污垢无法正常清洗，容易形成感染，引起阴道炎，造成阴茎上有黑色的东西，需要进行包皮环切术来进行治疗。
3、阴茎湿疹接触到不良的物质或自身免疫影响可能会刺激皮下的毛细血管，引起反应，导致阴茎湿疹，可遵医嘱外用糠酸莫米松乳膏、夫西地酸钠软膏等药物。
除此之外，还可能是人乳头瘤病毒感染等原因所引起，需要到医院进行相关检查。
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