多发性遗传性骨软骨瘤的发病原因尚不完全明了，可能的原因如下：
1、由于先天性胚浆缺陷。
2、由于骨骺板的错置移位。
3、从骨膜内层的残余幼稚细胞或化生而成的软骨细胞逐渐生长而形成骨赘。
4、由于骨膜生长不完全，不能约束骺软骨的增生，引起软骨畸形而形成骨赘。
5、由于骨骼在生长过程中干骺失去共塑形的能力，使干骺增宽并连续增殖而形成骨赘。近年有人认为，本症与酸性粘多糖的代谢紊乱有关。
遗传性多发性骨软骨瘤的合并症更较常见，包括骨骼畸形、骨折、血管及神经损伤、滑囊肿形成等，这些并发症与单发性骨软骨瘤所述相同，但恶变发生率高，约为5%。多发性遗传性骨软骨瘤累及骨骼时常伴有高钙血症，偶可继发为软骨肉瘤。
多发性遗传性骨软骨瘤患者，男性多见，有显著的家族遗传病史。所有的软骨内化骨的骨骼均可发病，其中以四肢长骨的干骺端最多见，常对称性发生，下肢发病多于上肢，下肢以膝关节周围骨骼最多。
早期肿瘤小，常无症状，一般在儿童和青春期由于骨赘增生成肿块，发生畸形，压迫附近软组织而疼痛时方被注意而发现。肿瘤在关节附近可影响关节功能，压迫神径时(特别是腓总神经)可引起相应的症状。多发性骨软骨瘤病在儿童早期就可发现，到青少年时，前臂可发生弓形畸形，手向尺侧偏斜，有时可有骨盆和胸廓变形。
遗传性多发性骨软骨瘤属于常染色体显性遗传性疾病，预防方法如下：
1、婚前健康检查
已确定恋爱关系的男女，在办理结婚登记手续之前应做一次全面系统的健康检查尤其要注意的是，避免近亲结婚近亲结婚的后代患有智力低下、先天性畸形和各种遗传病等比非近亲结婚的要多出好几倍
2、孕前遗传咨询
男女双方或一方，如果亲属中有遗传病患者，担心婚后是否会生出同样遗传病患儿，应咨询他们能否结婚，如果结婚后果是否很严重；双方中一方患有某种疾病，但不知是否遗传病，可否结婚，传给后代的机会如何医生会对此作出明确的诊断，并且告知合理的处理方法
多发性遗传性骨软骨瘤的检查手段主要有X线检查和显微镜检查：
X线表现
与孤立性骨软骨瘤相似，仅在许多骨上有不同大小的骨软骨瘤。膝部附近的骨胳，如股骨下端、胫骨下端、腓骨上端有大小不等的骨软骨瘤甚至膝关节上下可因骨软骨瘤的生长而交锁，甚至类似骨融合。除长管状骨外，肩胛骨的脊椎缘也是常见的好发部位，然后依次为掌骨、跖骨、指骨、趾骨、肋骨、脊椎和骨盆，髂骨嵴在与骺软骨的连接处，可有无数的小骨软骨瘤出现。颅骨从未发生过这种病损。
显微镜检查
可见软骨属透明软骨，若软骨生长活跃，可见软骨细胞排列成柱状。覆盖骨软骨瘤表面的骨膜与正常骨的骨膜相连接，在这些骨膜生长层，可看到局灶性软骨化生，在骨软骨瘤下面，偶而可见多少不等的砂粒状钙化物质。组织学检查主要是钙化或大部分坏死的软骨、钙化的软骨基质和钙化残屑，这表明软骨内化骨的正常过程发生局限性紊乱，以致原来应该破坏并被骨替代的钙化软骨基质堆积起来。
多发性遗传性骨软骨瘤患者的饮食应该注意以下两个方面。
适宜饮食：患者应对症选用止痛、消肿及减轻化疗、放疗反应的食品，如芦笋、藕、蟹、海龟、山楂、核桃、猕猴桃、银耳、香菇、大头菜、花粉、蜂乳等。
饮食禁忌：患者忌暴饮暴食和油腻之品；少用煎、熏、烤、盐腌制食品；禁烟、酒、辛辣及霉变食物。
多发性骨软骨瘤病的存在并不一定需要作切除术，只有在局部发生疼痛，或产生压迫症状时，才可考虑切除有症状或引起症状的骨疣。手术方法同孤立性骨软骨瘤。切除时必须将覆盖其上的骨膜一并切除，否则容易复发。若恶变成软骨肉瘤，可用肿瘤原位分离插入式微波天线灭活术，骨缺损可用异体骨重建。对骨盆的恶性变，处理比较困难，由于不易彻底切除，复发率很高，可能的话，应早期作半骨盆切除术。
对于比较严重的骨畸形，可待病人成年后，行截骨矫形术或骨端切除；合并肱桡关节或下尺桡关节脱位，而前臂旋转功能明显受限的可行桡骨头或尺骨头切除术；对患手尺偏明显的可行桡骨下端截骨术，胫骨明显外翻的可行胫骨近端截骨术。