肛窦开口向上，易积存粪便而引起感染，以致肛门括约肌痉挛，使肛窦引流不畅。感染不易控制，引起肛乳头发炎和肥大。自觉肛门部不适，排便时因粪便压迫肛隐窝，可感觉肛门疼痛，一般不甚剧烈，数分钟内消失。
除了一般症状外，还会引起其他疾病，本病并发肛乳头肥大，并从肛门脱出，可使肛门潮湿瘙痒。所以一经发现，需积极治疗，平时也应做好预防措施。
自觉肛门部不适，排便时因粪便压迫肛隐窝，可感觉肛门疼痛，一般不甚剧烈，数分钟内消失。若括约肌受刺激而挛缩则疼痛加剧，常可出现不排便时的短时间阵发性刺痛，并波及臀部和股后侧。急性期常伴便秘，粪便常带少许粘液，此种粘液常在粪便前流出，有时混有血丝。
保持排便通畅及肛门清洁，及时治疗慢性肠道炎症、便秘及腹泻等肛门有痔、漏病变时应及时就医本病严重影响患者的日常生活，所以应积极预防
1、详询肛门部有无不适、瘙痒或灼痛，有无粘液、血便。
2、肛门镜检查肛隐窝部位有无充血、水肿，有无肥大乳头及脓性分泌物。
肛窦炎的发生中医认为与湿热关系最为密切。因此，日常饮食中应注意忌油腻，内生湿热的食物应少吃，同时戒除烟酒及嗜茶的习惯。
多食清淡易消化且营养丰富的食物，如冬瓜、丝瓜、绿豆、胡萝卜、西红柿等。另外，如果饮食不当，可导致大便干燥，干硬的粪便可以撕破肛瓣，损伤肛门皮肤及黏膜，使细菌容易繁殖，引起肛腺感染。故平时可以适当多吃高纤维素的食物，如红薯、玉米、芹菜等。
老年如果没有糖尿病，可以经常服用蜂蜜，这样通过饮食的调节以防止便秘，保持大便通畅，有利于疾病的康复。手术后的肛窦炎病人，尤其是伤口经久不愈的患者还应注意增加营养，多食含有丰富蛋白质的食物如瘦肉、蘑菇、大枣、茄子、山药等。
一、中医治疗
1、内治法
湿热下注，肛门坠胀或瘙痒不适，或灼热疼痛，大便时疼痛加重，肛门潮湿；小便黄，口干口苦，苔黄腻，脉滑数。
辨证分析：湿热之邪，蕴于肠胃，下注肛门。气血不畅，则肛门坠胀，潮湿瘙痒，甚则疼痛；大便努挣，气血更加瘀滞不行，则疼痛加重；小便黄、口干口苦、苔黄腻、脉滑数等皆为湿热之象。
治法：清热利湿。
方药：止痛如神汤加减。
2、外治法
熏洗法用苦参汤煎水，先熏后洗，。
塞药法每次苦参汤熏洗后，用化痔栓塞人肛内，或用黄连素软膏涂于肛内。
二、西医治疗
1、非手术疗法
软化大便，便后及每晚用1∶5000高锰酸钾溶液坐浴，局部用消炎止痛栓剂如甲硝唑栓、复方玉红栓等。复方玉红栓每1000粒成分如下：紫草6.0g、苦参12.0g、松香30.0g、槟榔6.0g、麻油170.0g、磺胺粉25.0g、达克罗宁5.0g、可的松2.5g。
2、手术疗法
慢性或反复发作者，可在局麻下行肛瓣切除，以利引流，如有肥大肛乳头，应同时切除，然后继续非手术治疗，5～7d内用手指扩肛。
肛窦内已成脓者，或伴有肛乳头肥大、隐性瘘（内盲瘘者），宜行手术治疗。
（1）切开引流法
适应症单纯性肛隐窝炎已成脓者；或有隐性瘘者。
操作方法取截石位或侧卧位，肛周局部消毒，肛门局部麻醉，在双叶肛门镜下暴露病灶，沿肛窦作纵行切口，使引流通畅，创口用凡士林纱条压迫，术后每天便后坐浴，外涂黄连素膏或马应龙痔疮街或其他消痔膏。
（2）切除法
适应证本病伴有肛乳头肥大者。
操作方法准备同上，在双叶肛门镜下暴露病灶，将肛窦肛门办及肛乳头一并切除，用凡士林纱条压迫创面。术后每天换药一次。