抗原检测棉签和普通棉签的区别主要在于制造成分不同。抗原检测棉签根据厂商不同成分有细微差异，但是表面都布满柔软、不易掉毛的小绒毛，可以更轻松地沾取鼻黏膜上的分泌物。而普通棉签则通常采用光滑、易掉毛的长绒毛，不仅很难成功沾取分泌物进行检测，而且容易被污染导致检测结果不准。不仅如此，不同厂家制造出的试剂、提取液和棉签的内部成分均有所不同，因此也不建议混用。
在进行自我抗原检测时，需要注意将棉签捅至鼻内部1cm～2cm深处沾取分泌物，避免因害怕疼痛、沾取不足等因素干扰导致假阳性。在使用棉签时，注意严格按照说明书操作，禁止其接触任何物品，避免被污染。如果患者抗原检测出两条杠但是身体暂时没有出现任何症状反应时，有可能是操作不当导致假阳性，建议患者进行复诊确认。