三个月婴儿一直哼哼唧唧可能是由于缺钙或者胃肠功能紊乱等原因造成的，可以在医生指导下通过药物进行治疗。
1.缺钙。三个月婴儿一直哼哼唧唧可能和缺乏维生素D和钙有关。维生素D和钙的缺乏会提高神经的兴奋性，因此会引起婴儿睡觉时哼哼唧唧的现象，同时可能还伴有多汗、夜间惊醒等症状出现。可以在医生的建议下通过服用药物进行治疗，常见的药物有维生素D2、葡萄糖酸钙片、乳酸钙片等。
2.胃肠功能紊乱。三个月婴儿一直哼哼唧唧可能和胃肠功能紊乱有关。胃肠功能紊乱主要是由消化不良、饮食不规律等原因引起的，还可能会使婴儿出现腹胀、便秘的现象，同时还会伴有睡觉频繁使劲、发出声音等症状，建议在医生的指导下通过口服药物治疗，常用的有枸橼酸铋钾颗粒、马来酸曲美布汀片、小儿七星茶颗粒等。