类固醇5α-还原酶2缺乏综合征患者的基因分析显示有点突变，多见为误义突变，少见为缺失、剪切点和无义突变。约75％是纯合子突变，25％是杂合子突变。突变的结果是使酶与辅酶NADPH的亲和力或与睾酮的结合能力减低。
类固醇5α-还原酶(SRD5A)有2种同工酶，即SRD5A1和SRD5A2。二者的氨基酸系列50％同源，位于微粒体，以NADPH为辅因子，催化睾酮转化为作用更强的DHT。SRD5A1基因定位于5p15，有5个外显子，最适pH值为碱性，在肝脏和非生殖器皮肤表达。SRD5A2基因定位于2p23，有5个外显子，最适pH值为酸性，主要在生殖器皮肤和前列腺表达，在肝脏的酶活性随年龄的增长而逐渐减少，在非生殖器皮肤的酶活性3岁以后已不能测出。
由于类固醇5α-还原酶2缺乏综合征患者出生时和青春期后发生巨大的变化，他们的性别取向在出生时几乎都是按女孩抚养，青春期后又改为男性生活，可能会带来性别认同方面的心理问题。男性婴儿具有阴蒂样小阴茎并向下弯曲、会阴型尿道下裂、盲袋阴道、阴道口与尿道口分开。
本病患者的临床表现存在不均一性，约55％的患者有会阴型尿道下裂和假阴道，其余的患者可以是尿生殖窦存留、阴茎型尿道下裂或甚至是小阴茎和阴茎尿道，现将其具体介绍如下：
1、生殖系统
生殖系统表现为外生殖器两性畸形、小阴茎、会阴型尿道下裂、盲袋阴道、前列腺缺如或发育不全、睾丸位于腹股沟管或阴唇阴囊褶内。出生时往往作为女性抚养。
2、青春期发育
青春期正常启动，出现进行性男性化，变声、肌肉容量增加、阴茎增大，但是无阴毛、腋毛和胡须生长或稀少，无痤疮，无颞额角发际退缩，除个别患者外，一般无男子乳腺发育。青春期后不少患者又改变性别为男性。
类固醇5α-还原酶2缺乏综合征的早期诊断对于尽早确定性别取向是十分重要的SRD5A2基因突变在多数情况下酶活性残存不超过0.4％，少数患者酶活性可保存3％～15％，这些患者外生殖器男性化比较完整，足以使婴儿出生时被确定为男性性别考虑到青春期转换性别的发展倾向，在新生儿期作出正确诊断对性别决定是重要的
类固醇5α-还原酶2缺乏综合征多由于遗传所致，其常规检查项目如下：
1、患者在青春期后血清睾酮水平显著升高，但DHT水平没有成比例地升高，T/DHT比值可高达35～84(正常成年男子为12±3.1)，血清LH和FSH水平正常或轻度升高。
2、杂合子患者尿中C19-类固醇的5α-和5β-还原物(如雄素酮/原胆烷雄酮)比值中等度升高。
3、遗传基因检查。
类固醇5α-还原酶2缺乏综合征的饮食方面没有特殊要求，一般正常饮食就可以。要注意饮食要丰富，营养均衡。保证人体正常代谢所需的热量、蛋白质、维生素的需求。适当增加蔬菜、水果、瘦肉、鱼、奶、豆制品的摄入。保健方面要注意放松心情，树立信心，保持良好的心态，积极配合医生治疗。
类固醇5α-还原酶2缺乏综合征的早期诊断对于尽早确定性别取向是十分重要的。SRD5A2基因突变在多数情况下酶活性残存不超过0.4％，少数患者酶活性可保存3％～15％，这些患者外生殖器男性化比较完整，足以使婴儿出生时被确定为男性性别。考虑到青春期转换性别的发展倾向，在新生儿期作出正确诊断对性别决定是重要的。
有人报道1例9个月龄类固醇5α-还原酶2缺乏症患儿，用2％DHT乳膏涂布于腹部，25mg/d，12天后血清DHT水平为2.0mol/L(58g/dl)，达到了成年男子正常范围。治疗4个月，阴茎长度增长2cm(从1.8到3.8cm)，没有发现不良反应。同时应进行阴茎尿道成形术或尿道下裂修补术。但是DHT治疗仍在试验阶段，尚无正式商品上市，其长期疗效和安全性仍有待确定。
对于成年患者，睾酮脂(如庚酸睾酮、十一酸睾酮等)超生理剂量(250～500mg/周)肌注可使血清DHT水平达到正常范围，并有部分性增强男性化的效果，同时进行外生殖器男性方向的整形。
如果作为女性抚养，外生殖器需进行女性方向整形，同时切除双侧睾丸，青春期年龄后给予雌激素替代治疗。