现代医学认为，舌下囊肿的发病机理是由于导管阻塞后唾液潴留使导管或腺泡破裂，分泌液向外渗出所致。祖国医学认为，因心脾蕴热，痰湿凝结，致邪热上熏于口舌，热盛阴伤，气血俱燔，热毒壅结而形成。多并发于温热病之中，继发于病后之时，延误诊治者多预后不良。
本病和细菌感染具有直接的相关性，细菌感染可向周围正常的组织蔓延，严重病例或者全身抵抗力低下的患者，可因感染进入血液循环造成脓毒血症等感染。同时本病的囊肿可直接压迫食管以及气管以及周围组织，压迫食管可影响进食，压迫气管可影响呼吸，甚至直接危及生命。
通常先起于一侧口底舌下区，增大时可扩展于对侧，有时也可扩展至颏下或同侧颌下部。囊肿位于口底粘膜的深面，呈淡黄色、半透明的柔软包块。触诊有波动感，无压痛。增长缓慢。囊肿很大时，可影响说话、吞咽甚至呼吸。如并发感染可有疼痛等炎症表现。囊肿破裂时，溢出蛋清样粘稠液体，包块消失，但可复发。
术后处理
由于舌下囊肿常见不同程度的炎症细胞浸润可见伴有炎性反应存在因而在激光手术后不论囊肿大小都应给予抗生素治疗2周可口服、肌注或由静脉滴注给药同时还可给多簇维生素类制剂及有助于康复的方法治疗如术后用弱激光照射创面，一次20分钟，1日1次，10～15次一疗程，可减少用药量
1、临床体格检查
口底舌下区，增大时可扩展于对侧，有时也可扩展至颏下或同侧颌下部。囊肿位于口底粘膜的深面，呈淡黄色、半透明的柔软包块。触诊有波动感，无压痛。增长缓慢。囊肿很大时，可影响说话、吞咽甚至呼吸。如并发感染可有疼痛等炎症表现。
2、临床实验室检查
分泌物检查可找到病原体，血常规检查，白细胞明显增高，以中性粒细胞增高为主。
较大囊肿请注意及时的进行手术治疗。由于新生儿不能进食辅食，所以饮食无特殊要求，注意及时合理的喂养、加强营养即可。如果母乳喂养，乳母请注意加强营养，多吃瘦肉、鸡汤、鱼汤以及牛奶等高蛋白的食物，同时多吃点蔬菜、水果类等富含维生素和纤维素的食物，这样能够提高孩子的免疫力，对孩子有利。
由于舌下囊肿常见不同程度的炎症细胞浸润可见伴有炎性反应存在。因而在激光手术后不论囊肿大小都应给予抗生素（头孢克洛、头孢噻肟、阿莫西林克拉维酸钾均可）治疗2周。可口服、肌注或由静脉滴注给药。同时还可给多簇维生素类制剂及有助于康复的方法治疗。如术后用弱激光照射创面，一次20分钟，1日1次，10～15次一疗程，可减少用药量。