小儿鹅口疮的病因主要有以下几种：
1、母亲阴道有霉菌感染，婴儿出生时通过产道，接触母体的分泌物而感染。
2、奶瓶、奶嘴消毒不彻底，母乳喂养时，妈妈的奶头不清洁，都可以是感染的来源。
3、接触感染念珠菌的食物、衣物和玩具可导致鹅口疮。另外，婴幼儿在6～7个月时开始长牙，此时牙床可能有轻度胀痛感。婴幼儿爱咬手指、咬玩具，这样就易把细菌、霉菌带入口腔，引起感染。
4、在幼儿园过集体生活，有时因交叉感染可患鹅口疮。
5、长期服用抗菌素，或不适当应用激素治疗，造成体内菌群失调，霉菌乘虚而入，并大量繁殖，可引起鹅口疮。
小儿鹅口疮的并发症主要是以下三方面：
1、患儿口腔疼痛，会拒绝吃奶，造成食量减少，从而导致体重增长缓慢。
2、如果鹅口疮扩散到口腔的后部，有可能殃及食道。食管一旦受到牵连，患儿吞咽东西就会感到不舒服，甚至会因为怕疼，连水都拒绝喝，这样宝宝就有可能出现脱水。
3、鹅口疮如果不及时治疗，酵母菌还可能波及身体的其他部位。
小儿鹅口疮好发于颊、舌、软腭及口唇部的粘膜。白色的斑块不易用棉棒或湿纱布擦掉。口腔粘膜出现乳白色斑膜，周围无炎症反应，形似奶块，无痛。擦去斑膜后，可见下方不出血的红色创面。斑膜面积、大小不等。在感染轻微时，除非仔细检查口腔，否则不易发现，也没有明显痛感，或仅有进食时痛苦表情。严重时宝宝会因疼痛而烦躁不安、胃口不佳、啼哭、哺乳困难。
小儿鹅口疮在预防方面，应注意以下几点：
1、产妇有阴道霉菌病时，要积极治疗，切断传染途径
2、婴幼儿进食的餐具清洗干净后再蒸10～15分钟
3、哺乳期的母亲在喂奶前应用温水清洗乳晕，而且应经常洗澡、换内衣、剪指甲家长每次抱孩子时要先洗手
4、对于婴幼儿的被褥和玩具要定期拆洗、晾晒幼儿的洗漱用具尽量和家长的分开，并定期消毒
5、幼儿应经常进行一些户外活动，以增加机体的抵抗力
6、在幼儿园过集体生活的婴幼儿，用具一定要分开，不可混用
真菌感染引起的鹅口疮原因比较单纯，不需要进行其他方面的检查。如果宝宝的鹅口疮反复发作，可以刮下一点白斑送到检验室检测。通过检验能够确定酵母菌的类型，以便医生能更准确给患儿用药。
小儿鹅口疮的患者应多饮水，多吃新鲜水果及蔬菜，宜服用温凉、营养丰富的半流质或流质饮食，避免过热、过咸及酸辣的食物。
中医治疗小儿鹅口疮主要分为以下三种类型。
1、风热乘脾型
症见：唇舌或颊内齿龈及软腭等处有黄白色大小不等的溃烂斑点，少则1－2个，多则5－6个，呈圆形或椭圆形，边缘微红。患者疼痛不能进食，并出现烦躁口渴，小便赤，大便干，舌红苔黄，脉细数等症状。
治法：疏风清热解毒。
方药：凉膈散。
组成：黄芩9克，连翘12克，栀子7克，大黄5克，芒硝5克，竹叶6克，薄荷7克，甘草3克。
2、心火上炎型
症状：舌上糜烂或溃疡，色红疼痛，饮食困难，烦躁常哭，口干欲饮，小便短赤，舌红尖赤，苔薄黄，脉细数。
治法：清心泄热。
方药：泻心导赤汤。
组成：黄连5克，生地9克，竹叶9克，木通3克，甘草3克。
3、虚火上炎型
症状：口腔溃烂、斑点较少，表面色黄白，周围颜色淡红，神疲颧红，虚烦口干，舌红少苔，脉细数，且反复发作。
治法：滋阴降火，引火归原。
方药：甘露饮加肉桂1克。外涂口疮散。