1、一般认为与口腔环境状况不佳有关。正常情况下食物与舌腭粘膜的摩擦使丝状乳头角化层不停脱落，被上皮基底新细胞所替代。当疾病或疼痛使舌运动减少时，舌丝状乳头延迟脱落并有细菌和真菌覆盖而形成毛舌。因此，菌丛变化和缺乏舌运动是主要原因。
2、多见于口腔卫生不良，长期应用抗生素，过度吸烟以及头颈癌广泛放疗后的患者。可能由于改变了口腔内的正常环境，使丝状乳头过长或影响正常脱落而致，其黑色可能由于唾液成分的改变，黑根霉菌孢子产生的黑色素污染所致。
有学者研究发现，年长的恶性肿瘤患者容易发生黑毛舌，在其调查的恶性肿瘤病例中，22％的患者存在黑毛舌。
黑毛舌：是由于舌背部丝状乳头过度伸长和延缓脱落想出的毛发状的损害，病因一般与口腔卫生不良、过量吸烟及抗生素的长期应用、进食含色素的食物等有关。
舌背中部和后部有密集的黑色丛毛，舌中线区毛长密集色重，造边缘则丛毛减少，毛长由数毫米至1cm以上，表面可有食物残留，多无自觉症状，也可伴有口臭，口干和口苦等。
毛舌多见于口腔卫生不良，长期应用抗生素，过度吸烟以及头颈癌广泛放疗后的患者因此最好的预防方法是找出病因，除去致病因素，如戒烟、酒，少吃带色素的食物，更换可疑的药物，保持好口腔卫生可用牙刷刷洗毛舌区，去除霉菌及角化伸长的乳头，但要防止剪去过多而出血
舌背中部和后部有密集的黑色丛毛，舌中线区毛长密集色重。相关的检查：病理学检查发现丝状乳头锥形过度伸长，乳头间可见菌丝。
毛舌除了常规的治疗外，饮食上还要注意以下方面：高营养、易消化的食物。合理搭配膳食。此外，还要避免食用辛辣刺激性的食物。
1、对因治疗
明确病因或诱因后加以纠正，例如停用可疑药物和食物，积极治疗全身性疾病，改善口腔卫生环境等。
2、局部治疗
可用牙刷轻洗舌毛区；或用消毒剪刀仔细修剪过度伸长的丝状乳头，以减少其对腭部的不良刺激，但不能修剪太深，以免伤及粘膜表面；局部使用抗真菌药物治疗。