口腔菜花状乳头瘤的病因尚不明确，可能和环境因素、遗传因素、饮食因素以及孕期的情绪、营养等具有一定的相关性。目前研究认为本病和人类的乳头瘤病毒感染也具有直接相关性。
口腔菜花状乳头瘤病可造成其他皮肤黏膜的乳头瘤感染，形成寻常疣样的皮肤损害，也有并发生殖器的疣可能，本病也可以通过口交传播。
口腔菜花状乳头瘤为淡褐色疣状丘疹及息肉样肿块，一般累及整个龈黏膜，部分病例可出现整个口腔黏膜病变，甚至扩展至喉和气管，损害呈增殖性，口腔常散发恶臭。病程为进行性，常迁延多年，可发展为上皮癌。
口腔菜花状乳头瘤病预防的重点应针对人类乳头瘤病毒，可接种乳头瘤病毒疫苗，对某些类型的HPV具有抵抗作用同时洁身自好，避免多性伴侣，也可减少本病的发生
组织病理
口腔上皮乳头增生，浅层上皮细胞明显空泡化，少见或无角化，正常成熟过程有不同程度的丧失，不扩散至基底膜下方，中度细胞浸润，可见核有丝分裂，棘层明显肥厚。
口腔菜花状乳头瘤病患者的饮食需注意以下事宜：
1、注意饮食卫生，不吃发霉的粮食及其制品，不吃腌制的食物，不吃病死禽畜。
2、不吃烟熏、火烤、烧焦、油炸的食物，不吃过期或可能受真菌毒素污染的食物。
3、减少猪、牛、羊等红肉的摄入，避免过度肥胖。
4、控制食用盐和调料的摄入，少吃深加工食品。
5、不食用过硬、过烫食物。进食过于粗糙、过热过烫的食物。
口腔菜花状乳头瘤病属于乳头瘤病毒的感染，根据具体的皮损情况选择治疗方案，可行冷冻、激光和切除病变黏膜，但局部可有复发。也可试服甲氨蝶呤、氨蝶呤钠或巯嘌呤。同时也可以给予干扰素以及胸腺肽等免疫调节药物。