做了粪菌移植拉肚子发热可能是粪菌移植的正常不良反应，但也不排除是消化道出血导致的。建议患者及时就医，在医生指导下进行治疗。
1.不良反应：粪菌移植是临床上治疗消化道疾病的有效方法，主要是提取正常人粪便中的健康菌群，移植到患者的肠道中，以达到重建患者肠道具有正常功能菌群的作用。肠道菌群恢复正常之后，会进行蠕动等运动，因此粪菌移植通常在做完24小时之内，患者会出现腹泻、腹痛、发热等症状，此为粪便移植的正常不良反应，患者无需过度担心，一般可自行缓解。
2.消化道出血：可能是由于在操作过程中导致肠胃黏膜损伤，造成出血的症状，因此患者会出现肚子发热的不良反应。建议在医生的操作下注射醋酸奥曲肽注射液、生长抑素注射液等止血类药物进行治疗。