蒜心黑了通常是由于蒜从底部开始发霉，导致蒜心变黑，一般不可以食用，如果食用可能会对胃肠道造成负担，出现腹胀、腹泻等不适症状，但可以适量吃新鲜的蒜，对于身体所需要的营养物质有一定的补充作用。
当大蒜处于温度过高、潮湿等位置，长期放置后容易滋生微生物，出现霉菌，导致大蒜发霉，大蒜中霉菌的代谢产物有毒，如果食用后可能会对胃肠道增加负担，导致出现腹泻，腹痛，恶心呕吐等食物中毒的症状。因此建议常温下保存大蒜，避免存放于潮湿、高温的环境中。
大蒜中含有较为丰富的维生素B6、碳水化合物、钾、磷、以及粗纤维等多种营养元素，由于大蒜中营养成分较高，在食用新鲜大蒜后，在一定程度上能够刺激胃黏膜，促进胃液分泌，有利于食物的消化，在一定程度上能缓解便秘、消化不良等症状。