百天宝宝睡觉老是摇头，可能是环境因素、皮疹、缺乏维生素D或钙剂等因素引起的症状，建议及时去医院进行相关检查，明确病因后，根据宝宝的具体情况进行相对应的调整，也可在医生的指导下服用药物进行治疗，从而改善不适症状。
1、环境因素：如果室内环境温度较高、衣服穿得过多、被褥盖的过厚等，通常会导致宝宝分泌大量汗液，可能会促使宝宝用摇头的方式来缓解身体的不适。建议家长要适当调整室内环境，根据天气变化或室内温度来适当增减衣物，营造舒适、安逸的睡眠环境，通常可改善症状。
2、皮疹：通常是由于家长护理不当、汗液刺激等因素所致，可能会引起头部伴有热痱子或湿疹等瘙痒性的皮疹，通常在入睡之后，会通过头皮与枕套来回摩擦缓解局部的不适感。可在医生的指导下使用氯雷他定糖浆、地氯雷他定干混悬剂、盐酸西替利嗪片等药物进行治疗。
3、缺乏维生素D或钙剂：百天宝宝睡觉老是摇头，可能是缺乏维生素D或钙剂引起的，宝宝的大脑皮层兴奋性增高，可能会出现睡觉老是摇头，还会伴有枕秃、多汗、方颅或睡眠不安、哭闹等症状。可在医生的指导下服用药物进行治疗，如小儿碳酸钙D3颗粒、赖氨酸磷酸氢钙颗粒、葡萄糖酸钙口服溶液等。
除了以上这些原因外，也可能是由于宝宝外耳道有湿疹或者皮炎等原因导致的，建议在医生的指导下进行治疗。