端厕根据家用和公共，可能传染不同疾病。虽然可能感染，但相对感染几率一般较小。家用端厕可能引起炎症疾病。公用端厕可能引起艾滋病、梅毒、淋病等疾病。
1.家用端厕：最常见可能感染的是大肠杆菌。如果不慎通过尿道口或者阴道感染，会引起尿道炎、膀胱炎、尿路感染、阴道炎等疾病，导致患者出现尿频、尿急、尿痛、腰部疼痛等临床症状。
2.公用端厕：可能由间接传播引起艾滋病、梅毒、淋病等疾病。多因携带这些病原菌的患者，通过使用公共厕所的设施，将病原菌遗留在设施上面，下一个人通过间接的接触从而感染疾病。虽然几率较小，但还是要特别注意，避免直接接触端厕，而且要防止厕所的水溅入到外生殖器引起感染。