支原体感染白细胞下降急剧需要进行抗感染治疗，使用大环内酯类药物，如阿奇霉素、红霉素、克拉霉素，或喹诺酮类药物，常用的有左氧氟沙星、莫西沙星等。需要结合感染的情况选择用药，以更好的控制感染的症状。如果临床症状比较轻，口服红霉素以及阿奇霉素治疗即可；如果呼吸系统以及生殖系统的重症感染，需给予阿奇霉素静脉治疗。
临床上肺炎支原体、人型支原体、生殖支原体及解脲脲原体对人体都有致病作用。出现肺炎支原体感染可见用氨基糖苷类以及氟喹诺酮类药物如链霉素、莫西沙星进行治疗。泌尿生殖系统支原体感染通常是由人型支原体、生殖支原体或解脲脲原体导致，可以用克林霉素、多西环素及氟喹诺酮类药物如左氧氟沙星、莫西沙星等进行治疗。
在正常人的体内，存在一定数量的支原体，平时并不致病，因为支原体的致病能力比较弱，一般不会侵入血液中。只有当人体抵抗力下降时，就容易出现机会感染。因此，要预防支原体感染，一般就需要增强个人体质。