一般情况下，没有婴儿眼药水哪种好这种说法。通常根据症状选择对症的眼药水是比较好。由于大部分眼药水都属于化学药品，其中化学元素含量较高，并且很多眼药水中都含有防腐剂成分，长时间使用会对眼睛造成一定影响。而婴儿的眼睛正处于生长发育的阶段，长期使用不当的眼药水可能会影响婴儿的眼睛发育。所以选择眼药水时，尽量选择不含防腐剂的眼药水，该类眼药水一般副作用较小且对眼部刺激较轻。
大部分的成人眼药水，婴儿都可以进行使用，但需要在医生的指导下根据病症来进行选择。如果婴儿出现青光眼，一般可以应用降眼压的眼药水；出现细菌性感染，通常需要应用抗生素类眼药水如左氧氟沙星、妥布霉素等。出现病毒性感染，一般需要应用抗病毒类眼药水如阿昔洛韦、更昔洛韦眼药水等。而发生过敏反应，则需要应用抗过敏的眼药水来进行治疗。