萎缩性胃炎一般不能自愈，萎缩性胃炎是因为长期慢性炎症刺激导致胃黏膜固有腺数量减少、功能低下所致，早发现早治疗还是可以将萎缩性胃炎转化为浅表性胃炎或被治愈的。患者饮食上注意规律进餐、细嚼慢咽、营养丰富均衡等。
治疗上可以给予瑞巴派特、替普瑞酮保护胃黏膜，多酶片或胰酶片促进消化。对于幽门螺杆菌感染所致的萎缩性胃炎，需要杀幽门螺杆菌治疗，如服用克林霉素、阿莫西林、兰索拉唑、果胶铋等药物治疗。对于十二指肠－胃反流所致的萎缩性胃炎，需要给予多潘立酮、西沙比利等胃动力药促进胃排空治疗。对于自身免疫因素所致的萎缩性胃炎，需给予强的松、泼尼松等药物进行免疫抑制治疗。