由于细菌感染而引起的发烧咳嗽通常一周左右即可恢复，具体病程持续时间还需根据患者的体质差异、病情程度等情况而定。一般在受到大肠杆菌、克雷伯杆菌属、流感杆菌等细菌感染后，可出现发烧、咳嗽的症状，或伴有咽痛、扁桃体肿大等表现。
如果明确引起发烧和咳嗽现象的病原体是细菌，在药物治疗上可选择抗生素，常用的有阿莫西林、头孢呋辛、阿奇霉素等。若是发烧时体温超过38.5℃，可在医生的指导下适当服用退烧药，例如对乙酰氨基酚、布洛芬等。服药治疗期间应注意休息，保持室内适宜的温度和湿度，增加水分的摄入。平时需均衡膳食，保证营养。