病毒的垂直感染是指通过胎盘或分娩时经产道感染，病毒的垂直感染指母亲直接感染胎儿，新生儿或者婴儿。病毒垂直感染包括出生前感染，出生时感染和出生后的感染。在怀孕的中后期检查病毒定量，如果病毒定量过高，及时口服，比较安全的抗病毒药物，直到宝宝出生之后，可注射相对应疫苗。
先看出生前的感染，经胎盘或子宫颈感染胎儿会宫内感染，宫内感染时如果孕母系原发感染，病毒经母体多形核白细胞和淋巴细胞转运到胎盘感染胎儿，或者病毒引起母体胎盘绒毛膜炎再感染胎儿。若为孕母为子宫颈病毒潜伏活化，病毒可经子宫内膜逆行传播，感染胎儿，胎儿在孕早期感染后，可引起宿主免疫耐受，使病毒在细胞内缓慢增殖而导致器官损害，易导致流产、死胎或者是宫内发育迟缓，智力低下，听力视力损伤以及先天性的畸形等。