抗甲状腺过氧化物酶抗体大于1000IU/ml，往往代表着患者甲状腺存在炎症，需及时就医检查甲状腺功能，明确患者甲状腺炎症类别后进行针对性治疗。
1.甲状腺炎症通常是由自身免疫系统、病毒或细菌感染所引起的甲状腺滤泡结构被破坏，可引起患者甲状腺功能减退（简称甲减）、甲状腺功能紊乱等，若不及时治疗，可发展为永久性甲减。患者若是无症状或症状较轻通常可不给予特殊治疗，若是患者甲状腺区域出现水肿、疼痛感等症状，可在医生指导下采取药物治疗或手术治疗。
2.若是自身免疫系统出现异常引起的甲状腺炎症，可应用泼尼松、水杨酸等药物进行治疗；若是由于病毒感染所致，可应用利巴韦林、奥司他韦等抗病毒药物；若是由于细菌感染所致，可应用阿莫西林、头孢克肟等抗菌药；若患者出现甲状腺功能减退或甲状腺功能紊乱可应用左甲状腺素片、左甲状腺素钠片等药物。
3.患者所应用的药物都需要严格遵照医嘱服用，若患者甲状腺肿大明显，压迫气管影响日常生活，可在医生指导下选择手术治疗，如峡部切除术或甲状腺部分切除术。患者在日常生活中应当定期监测甲状腺功能，保持心态平和，甲状腺炎患者避免进食含碘量丰富的食物，例如海带、紫菜等，但甲减患者可以食用此类食物。