一般情况下，两耳朵内痒痒可能是真菌感染、耳湿疹或者外耳道炎等原因引起，建议通过应用药物、改善生活习惯等方式治疗。两耳朵内痒痒还可能是其他原因引起，建议及时前往专业医院咨询医生，在医生的指导下进行下一步处理。
1、真菌感染：频繁性对耳朵进行擦拭或者挖耳，可能导致耳道皮肤损伤后引起真菌感染，从而出现两耳朵内痒痒的情况。建议遵医嘱应用盐酸特比萘芬乳膏、硝酸咪康唑软膏等药物进行治疗。同时，日常合理进行耳部护理，避免经常性清洁。
2、耳湿疹：两耳朵内痒痒还可能是耳湿疹导致，耳湿疹主要是过度紧张或遗传等原因导致，常伴随瘙痒、水疱等症状，建议及时前往专业医院，遵医嘱应用他克莫司软膏、糠酸莫米松乳膏等药物治疗。
3、外耳道炎：外耳道炎也有可能导致两耳朵内痒痒情况的出现，外耳道炎主要是细菌感染或营养不良等原因导致，常伴随头晕、瘙痒等症状，建议及时前往医院，在医生的指导下应用氟康唑滴耳液或者头孢氨苄胶囊等药物进行治疗。