何首乌是一味比较好的补益类药物，主要的副作用是导致腹泻、肝损害、结肠黑变病等，因此需要在医生的指导下选择和使用。
1、何首乌含有蒽醌类，长期过量地服用势必会产生一些毒副作用，比较常见的是容易引起腹泻，而且不跟其他药物配伍会引发结肠黑变病。何首乌建议在煎煮后服用，不赞成生用。
2、何首乌的主要副作用是肝脏损害，若少数人用了以后发现肝功能损伤的情况，原因与药物的炮制、药物的质量、还有患者的体质等因素有关系。甚至严重时会出现黄疸等情况。需要特别注意的是，何首乌服用的量不能过大，以及服用的时间太可太长。