怀孕第九周小腹轻微疼痛，有可能是生理现象、先兆流产、宫颈炎等情况引起。出现这种情况之后，建议患者先到正规医院接受检查，明确病情后在医生的指导下通过改善生活习惯、应用药物等方面进行治疗和调养，使身体的情况得到改善。
1、生理现象：怀孕九周的孕妇可能会因为身体的雌激素，孕激素大量分泌，从而引起腹部轻微不适。只要疼痛症状不严重就无需特殊治疗，孕妇平时注意休息，保持轻松的态度，经过一段时间就能好转。
2、先兆流产：怀孕第九周属于孕早期，在孕早期如果没有注意休息或者孕妇身体本身较虚弱，就有可能出现先兆流产的现象，使人感觉肚子隐隐作痛。建议在医生的指导下应用黄体酮软胶囊、参茸保胎丸等药物进行治疗，同时也要注意多休息，保持稳定的情绪。
3、宫颈炎：怀孕之前若是患有宫颈炎，孕期没有护理好身体，就有可能引起宫颈炎发作，在炎性因子的刺激下，孕妇可能会出现下腹部疼痛症状。建议在医生的指导下应用克林霉素磷酸酯凝胶、妇科苦参抑菌凝胶等药物进行治疗。