孩子清晨发热，考虑可能跟感染、过敏、甲状腺功能亢进等原因有关。感染因素是常见的导致孩子清晨发热的原因，非感染因素也可导致孩子发热。这时应针对病因，配合医生接受药物、放疗、造血干细胞移植等治疗，以改善病情。
1、感染
局部或全身的感染可诱发机体产生炎症反应，影响体温调节中枢正常的生理功能，可导致孩子清晨发热。若为细菌感染，可配合医生使用阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片等抗感染药物。
2、过敏
食物、药物过敏会诱发机体产生变态反应，也可能会导致孩子清晨发热。过敏时首先要避免与过敏物质的接触。其次可配合医生服用盐酸左西替利嗪颗粒、氯雷他定片的抗过敏药物。
3、甲状腺功能亢进
孩子患有甲状腺功能亢进，体内的甲状腺激素分泌增多，机体处于高代谢状态，也可能会导致孩子清晨发热。这时可配合医生服用甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片等抗甲状腺药物。