三个多月的宝宝发烧38.5℃，一般可根据病因进行治疗，大多是由于细菌、病毒、支原体、寄生虫等病原微生物感染人体导致的感冒、肺炎、胃肠炎等病症引起的。建议家长及时带宝宝去医院就诊，在医生的指导下使用药物进行治疗。
1、感冒。感冒大多是由于病毒感染上呼吸道引起的，通常会使宝宝出现发烧、鼻塞、流鼻涕等症状，可以在医生的指导下使用小儿氨酚黄那敏颗粒、头孢拉定干混悬剂等药物进行治疗。
2、肺炎。肺炎通常是由于细菌或病毒感染肺组织引起的，通常会使宝宝出现发烧、咳嗽、咳痰等症状，可以在医生的指导下使用小儿肺热咳喘颗粒、小儿清热利肺口服液等药物进行治疗。
3、胃肠炎。胃肠炎大多是由于细菌、寄生虫等病原微生物感染胃肠道引起的，通常会使宝宝出现发烧、腹痛、腹泻、呕吐等症状，可以在医生的指导下使用鞣酸蛋白酵母散、蜡样芽孢杆菌活菌胶囊等药物进行治疗。