六岁儿童发烧39℃可能是由于上呼吸道感染、肺炎、脑炎等因素引起的。建议要根据引起儿童发烧的病因进行治疗，同时日常生活中要适当加强体育锻炼，如跑步、游泳、打羽毛球等，通常可以增加机体的抵抗力或免疫力，减少再次发病的概率。
1、上呼吸道感染：通常是由于病毒或细菌感染引起的，儿童可能会出现不同程度的发烧、流鼻涕、打喷嚏、鼻塞等症状，可在医生的指导下使用抗病毒口服液、连花清瘟颗粒、金银花颗粒等药物进行治疗。
2、肺炎：通常是由于病毒、细菌等病原体感染所引起的，儿童一般会出现发烧、咳嗽、咳痰等不适症状，可在医生的指导下使用药物进行治疗，如头孢克肟颗粒、阿莫西林颗粒等。
3、脑炎：通常是指脑实质受到病原体侵袭所导致的一种炎症性病变，儿童可能会出现不同程度的发烧、抽搐、嗜睡等不适症状，建议要及时去医院进行诊治，由专业医生采取静脉滴注的方式进行治疗，常用的药物有甘露醇注射液或者甘油果糖注射液等。