屁眼长小红疙瘩可能是毛囊炎、肛门湿疹、尖锐湿疣等病症所致，可以通过使用红霉素软膏、氯雷他定片、二氧化碳点阵激光等方法来做治疗。还需要到医院做相关性的检查，才可以准确地判断出病情原因，同时在治疗期间还需要做好肛门部位的卫生和清洁工作。
1、毛囊炎：毛囊炎是由于毛囊受到了细菌感染所致，会导致毛囊就会出现肿胀感和疼痛感，也可能会导致局部形成脓包，严重的还可能会引起破损或者是脓性分泌物渗出。可以通过使用红霉素软膏和莫匹罗星软膏等来涂抹。
2、肛门湿疹：在肛门受到过敏原刺激之后，就有可能会导致皮肤出现过敏反应，有可能会导致局部出现湿疹，会引起丘疹和红疹，并伴有剧烈的瘙痒感。可以遵医嘱通过口服盐酸西替利嗪片和氯雷他定片等药物来做治疗。
3、尖锐湿疣：尖锐湿疣是由于受到了人乳头瘤病毒感染所引起，会导致肛门和生殖器周围出现很多的小疣体，类似于小红疙瘩，并伴有瘙痒感以及糜烂。可以通过二氧化碳点阵激光和液氮冷冻治疗等方法来做治疗。