通常情况下，枯草芽孢杆菌可以吃，但不能长期吃。枯草芽孢杆菌对身体有一定的好处，其中的活性物质能够有效抑制一些病菌的增长，对于提高身体抵抗力有一定的帮助，同时其中的菌体对于胃肠道部位的菌体也有调节作用。因此如果在日常生活中有饮食不当造成消化不良、腹泻的症状，可以吃枯草芽孢杆菌帮助缓解，减轻症状。
在吃枯草芽孢杆菌时需要注意，此种益生菌不可以长期吃，因为枯草芽孢杆菌具有调节菌群的功能，对于体内菌群失调的患者可以帮助调节，但如果菌群正常的人长期食用就可能导致菌群失调。一般可以选择在饭前吃枯草芽孢杆菌，同时在应用此种药物期间，也可以多吃清淡的蔬菜水果，尽量不吃辛辣刺激性食物，可以适当进行运动锻炼，这样有利于更好地发挥出药效。