睡醒后眼角尾处疼，可能是结膜炎或麦粒肿等原因导致的，建议去医院就诊，完善检查，明确病因，在医生指导下使用药物或改善日常生活方式等进行调理。
1.结膜炎
由于细菌或病毒感染导致结膜炎，可出现眼部疼痛，酸胀等在睁眼后眼角尾处疼痛。若结膜炎为细菌感染所导致的，应遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、氯霉素滴眼液等。若为病毒感染所引起的应遵医嘱使用阿昔洛韦滴眼液、更昔洛韦滴眼液等。同时应注意日常生活中，应保证充足睡眠和休息，避免过度用眼。
2.麦粒肿
由于卫生习惯不佳导致眼睑发炎形成麦粒肿，可在睡醒后眼角尾处疼。若疼痛较轻微，通常无需经过特殊治疗，可自行缓解。若疼痛较为剧烈，应遵医嘱使用止痛药物如布洛芬缓释胶囊、阿司匹林肠溶片等。