通常睡醒后眼睛有很多分泌物可能是由于结膜炎、角膜炎等原因导致，一般可以通过在医生指导下使用药物、改善用眼习惯等方式进行治疗。
1.结膜炎
结膜炎往往是由于细菌感染、异物刺激等原因引起，常伴有眼部干涩有异物感、结膜分泌物增多等症状，所以可能造成睡醒后眼睛有很多分泌物的现象，患者应遵循医嘱应用吡嘧司特钾滴眼液、富马酸依美斯汀滴眼液等药物进行治疗。患者在日常生活中要注意培养健康的用眼习惯，不要用手揉眼睛，降低使用隐形眼镜和眼部化妆产品的频率。
2.角膜炎
角膜炎与细菌感染、免疫力下降等原因有关，患者常会出现眼睑痉挛、角膜分泌物增多、畏光流泪等症状，所以可能造成睡醒后眼睛有很多分泌物的现象，一般可在医生指导下使用药物进行治疗，如氟康唑片、阿昔洛韦分散片等。