长期肚子咕咕叫肚子疼，可能是由于消化不良或者胃炎的原因导致的。可以到医院进行相关的检查，确定病因后，在医生的指导下通过口服药物的方法进行改善。
1、消化不良：出现消化不良的现象通常是由于吸烟、喝酒、着凉或者暴饮暴食等原因引起的，因为这些不良的习惯会导致胃肠道发生紊乱，引起肚子咕咕叫肚子疼的症状，可以在医生的指导下服用人参归脾丸、香砂养胃丸等健脾和胃的中药进行调理，能够缓解消化不良的现象。
2、胃炎：胃炎的患者通常在发病期间会出现反酸、烧心、腹胀、上腹部疼痛以及恶心、食欲不振等症状，胃炎会导致胃黏膜的消化吸收功能减弱，导致过多的气体和水分在胃部蓄积，出现肚子咕咕叫肚子疼的现象，可以在医生的指导下服用奥美拉唑肠溶胶囊、枫蓼肠胃康颗粒或者枸橼酸铋钾颗粒等药物进行治疗。建议患者在平时日常生活中养成良好的饮食习惯，一日三餐定时定量。