一般情况下，肚脐右边三厘米处疼可能是肠结核、阑尾炎等原因导致的。建议患者通过药物、手术等方式进行治疗，患者需要注意多卧床休息，减少运动量，加强饮食卫生，多吃易消化的米粥、燕麦等，保证充足的水分摄入。
1.肠结核：主要考虑患者由于结核分枝杆菌感染等因素引起肠结核，局部可能出现肿块，临床表现为右下腹疼痛，也可能会出现肚脐周围疼痛、全腹疼痛等症状，建议患者在医生的指导下应用异烟肼片、吡嗪酰胺片等药物进行治疗。
2.阑尾炎：主要考虑由于粪石、食物残渣堵塞，病菌感染等因素导致患者阑尾管腔受损时，可能会引起阑尾炎，进而对周围组织、细胞造成损伤，引起局部炎性水肿，压迫神经导致患者肚脐右边三厘米处疼的症状。建议患者在医生的指导下进行腹腔镜阑尾切除术、开腹阑尾切除术等手术进行治疗。