脚趾头上面长跖疣可以使用物理治疗如液氮治疗或激光切除等方法，也可以采用注射干扰素的方法进行治疗。长跖疣的患者应该避免搔抓和接触跖疣部位，容易引发新的接触感染。
1、物理治疗
液氮冷冻和激光切除是常见的切除跖疣的方法。激光切除时间较快，液氮冷冻周期比较长，一般要坚持两到三周以上，冷冻后水疱脱落则跖疣消失。物理治疗适合用于跖疣面积小，数量不多的患者。
2、注射干扰素
出现了大面积数量多的跖疣后，可以考虑注射干扰素来进行治疗。但是干扰素有抗病毒作用，打完之后有些患者可能会出现于类似于发烧的症状，一般不影响身体健康。