小孩吃了两天药还在发烧可能是由于细菌感染、胃肠炎或者肺炎等原因引起的，可以通过口服药物的方法进行改善。此外，在发烧期间多给小孩喝一些温开水能够促进身体的新陈代谢，促进排汗，还能够加速药物的吸收，有利于疾病的恢复。
1、细菌感染：由于小孩的身体抵抗力较弱，容易受到细菌的侵袭，细菌进入到体内后会引起细菌感染，导致出现小孩吃了两天药还在发烧的情况，可以在医生的指导下服用阿莫西林颗粒、头孢克洛颗粒等进行治疗，必要时还应在医生的指导下搭配服用退烧的药物，比如布洛芬颗粒、复方锌布颗粒等。
2、胃肠炎：可能是由于小孩饮食不当导致的，通常伴有腹痛、腹泻等症状，如果受到了炎症的感染，会出现发烧的情况，可以在医生的指导下口服蒙脱石散、阿莫西林颗粒等药物。
3、肺炎：肺炎通常是由细菌、病毒等因素引起的感染，通常伴有发烧、咳嗽、乏力以及咳痰等不适的症状，可以在医生的指导下服用利巴韦林颗粒、阿奇霉素颗粒等药物进行治疗。
在服用药物后，如果病情没有得到明显的缓解，需要及时前往医院就医。