黄豆芽生根了一般是可以吃的，适量食用可以用于改善脾胃较为湿热、大便黏稠、高血脂等症状，黄豆芽的根部不容易消化，味道和豆芽是差不多的，对健康不会造成影响。但是消化不良的人群不建议过多食用，黄豆芽长根后没有毒素，但是根部会影响整体口感，如果患者患有消化不良吃了生根后的黄豆芽后，可能会引起肠胃不适，甚至会出现腹痛、腹泻等症状，影响到肠胃健康。
黄豆芽的根中含有丰富蛋白质以及维生素，而且黄豆芽在生根到4天~12天时，其中含有的维生素C含量是最高的，此时吃有助于为人体补充所需要的各种营养成分。日常在吃黄豆芽时，建议搭配肉类或鸡蛋等，有利于为人体补充所需要的各类营养物质，以及保证摄入的营养均衡，确保身体健康。