早上起来舌头牙齿黑了可能是由于色素沉着、霉菌感染等原因引起的，建议患者在专业医生的指导下通过改善习惯、应用药物等方式进行治疗，缓解症状。
1.色素沉着：早上起来舌头牙齿黑了，可能是由于色素沉着导致出现的一种现象。建议患者在日常生活中避免食用浓茶、咖啡等含色素比较多的食物，在食用后也要注意及时漱口，并养成早晚刷牙的习惯。
2.霉菌感染：如果患者在长时间并且大剂量地使用抗生素的情况下，可能会导致出现霉菌感染。在这种情况下，建议患者及时就医。必要情况下，可以在专业医生的指导下通过使用氟康唑片、碳酸氢钠片等药物进行治疗。