宝宝半夜发烧手脚发热，可能是病毒引起的上呼吸道感染、肠胃炎等疾病导致的，建议及时前往医院就诊，在医生指导下应用物理或药物等方式进行降温处理。
1.上呼吸道感染
由于宝宝免疫力及抵抗力较为低下，则较容易受病毒感染，从而引起上呼吸道感染出现半夜发烧的症状，随着宝宝体温升高，会出现手脚发热的现象。可在医生指导下使用物理降温，如应用退烧贴、局部冷敷等方式进行降温处理，同时治疗宝宝上呼吸道感染需遵医嘱使用药物，如布洛芬混悬液、复方氨酚烷胺颗粒等进行治疗。
2.肠胃炎
由病毒引起的肠胃炎，其临床症状也可表现为半夜发烧，手脚发热的症状，这是由于夜间神经系统兴奋度较低，从而体温调节中枢异常出现发烧。治疗病毒感染引起的肠胃炎，需在医生指导下使用药物，如利巴韦林颗粒、多酶片等进行治疗。