一般情况下，发烧的孩子睡醒说头疼可能是病毒性感冒、病毒性脑炎等原因导致，患者可根据医生指导使用药物、物理疗法治疗，同时注意日常增加机体免疫力。
1.病毒性感冒
病毒性感冒通常是由病毒感染、身体抵抗力低下等原因导致，患者可能会出现头痛、恶心、浑身无力、心率增快等症状，同时孩子在发热后会出现头疼或四肢酸痛等症状。患者可根据医生指导通过温水擦拭的物理方式降温，也可根据医嘱服用布洛芬颗粒、对乙酰氨基酚滴剂等药物缓解治疗，同时需要多饮水，保证饮食清淡，避免摄入辛辣刺激性食物。
2.病毒性脑炎
病毒性脑炎通常是由病毒入侵中枢神经系统所致，患者会出现高热、呕吐、咳嗽、全身酸痛等全身不适症状，儿童发热会伴随头疼症状。患者需要及时就医，可根据医生指导进行物理降温，根据医嘱使用阿昔洛韦片、注射用更昔洛韦等药物抗病毒治疗。日常生活中应对患者使用过的衣物进行彻底消毒，整体环境保证通风。