做完胃肠镜后便血水大部分是由于肠道黏膜受到损伤引起的，也可能是由于肠道息肉等因素导致的，可根据具体病因在医生的指导下使用药物进行治疗，也可采取手术的方式缓解便血水的症状。
1、肠道黏膜受损。胃肠镜一般是通过将带有胃肠内窥镜的纤维软管从患者口腔延伸至胃中，以达到观察胃、食管和十二指肠的状态。在检查过程中可能会使肠道粘膜受到损伤，从而出现便血水的情况，一般出血不太严重，无需过多干预，多数患者会自然停止出血。
2、肠道息肉。肠道息肉通常是指黏膜表面突出到肠腔内的隆起状生物，大多数会有腹痛、消瘦、贫血、便血水、稀便等症状。可以在医生的指导下，使用阿司匹林肠溶胶囊、塞来昔布胶囊等药物进行治疗。也可使用结肠镜手术、显微镜手术切除、电灼切除术等手术方式，进行切除肠道息肉，改善患者便血水的现象。