睡醒后肚子咕噜咕噜响可能是属于生理性肠鸣、胃肠功能紊乱等现象引起的症状，需要根据具体情况选择一般治疗或药物治疗等方式改善，能让症状逐渐得到缓解。
1.生理性肠鸣。患者睡醒后有排便习惯或者是腹部受凉、饥饿等，都有可能会出现睡醒后咕噜咕噜响现象，属于常见的生理性现象，并不需要做过多担心，在及时调整以上几种因素后症状会得到改善。
2.胃肠功能紊乱。近期饮食不当，可能会引起胃肠道功能紊乱，在食物传输过程中容易出现堵塞或紊乱等现象，从而引起在睡醒后肚子有咕噜咕噜响，可以在医生的指导下口服益生菌调理肠胃菌群，有助于症状的改善，常见使用益生菌包含地衣芽孢杆菌活菌颗粒、酪酸梭菌二联活菌散等，在使用益生菌调理期间，做好腹部的保暖措施。