宝宝100多天睡着后总是偶尔轻微晃动头可能是由于正常的生理性原因或者缺乏维生素D等原因导致的，建议家长及时关注宝宝的变化，可以通过口服药物的方法进行改善。
1、生理性原因：由于宝宝比较小，身体各器官处于发育时期，特别是脑神经中枢系统还没有发育完善，不能支配四肢的活动，所以会出现睡着后总是偶尔轻微晃动头的现象，这是一种正常的生理现象，随着宝宝年龄的增大以及脑神经逐步发育完善，这种症状会自行消失。
2、缺乏维生素D：由于宝宝正处于生长发育时期，生长速度比较快，如果身体内缺乏维生素D会导致宝宝的大脑神经组织的兴奋性增加，出现睡眠不安、睡不安稳的现象，导致睡着后总是偶尔轻微晃动头的情况，家长可以在医生指导下及时补充维生素D，比如维生素D或者维生素AD滴剂等。