长期喝黑咖啡一般对身体有一定的损害，容易出现失眠、骨质流失、肠胃不适等多种不适。长期喝黑咖啡容易对身体产生一定的损害，如果患者本身患有高血压，在长期饮用黑咖啡会使血压升高。由于黑咖啡中含有较多的咖啡因成分，如果长期饮用黑咖啡，可能会导致中枢神经处于兴奋状态，进而引起失眠。如果大量饮用黑咖啡，可能在一定程度上会导致钙离子的流失，从而诱发骨质疏松的出现。由于咖啡中含有较多的咖啡因，而咖啡因会刺激胃黏膜，如果长期饮用黑咖啡容易对肠胃造成不适。
黑咖啡含有丰富的矿物质、碳水化合物、维生素及少量蛋白质等多种营养元素。由于咖啡中含有较多的咖啡碱，适量饮用黑咖啡可以提神醒脑，能够提高工作效率，从而更好地工作。