小南瓜里面长籽了一般还能吃，并不会对人体造成不适感，但不建议过量食用。食用小南瓜能够为人体补充一定量的营养物质及矿物质，如果过量食用可能会刺激肠胃，出现腹痛、腹泻等不适症状。
小南瓜中含有较为丰富的碳水化合物、维生素、粗纤维、胡萝卜素等营养物质，也含有一定量的钾、铜、磷、铁等矿物质。适量食用小南瓜，可以补充人体所需的营养物质及矿物质，也可以在一定程度上提高机体的免疫力。小南瓜中的碳水化合物可以为人体提供一定的热量，维生素及胡萝卜素均能够在一定程度上促进眼睛的发育，粗纤维对促进肠胃蠕动速度有一定的帮助。
如果长时间过量食用小南瓜，其中小南瓜中的淀粉，会加重肠胃蠕动的负担，引起腹胀、腹泻等不适症状，小南瓜属于低热量食物，过量食用会导致脂肪堆积在机体内，使人体逐渐出现肥胖的现象。